Šv. Kristoforo gimnazijos mokinių ir klasių skaičius po rekonstrukcijos išliks toks pat – 24 klasės, tačiau visa gimnazijos vidaus struktūra bus iš esmės perplanuota. Numatyta perplanuoti vidaus erdves, jas naujai įrengti ir sumontuoti naujas inžinerines sistemas. Modernizuojamos inžinerinės sistemos leis reikšmingai padidinti pastato energinį efektyvumą. Įmonė turės suprojektuoti ir naują apie 300 kv. m priestatą, kuriame bus įkurti modernūs persirengimo kambariai sporto veikloms, vietoje dabar pusaukščiuose esančių patalpų, nepritaikytų fizinę negalią turintiems mokiniams. Projektuojai jiems turės užtikrinti galimybę patekti į visus pastato aukštus liftais. Planuojama atnaujinti ir mokyklos prieigas – jos bus pritaikytos žmonėms su negalia. Naujai bus statoma ir projekte numatyta požeminė priedanga.